南方医科大学实验动物中心由实验动物所、实验动物学教研室、Ⅱ、Ⅲ级动物实验部三个部门组成。南方医科大学实验动物所是实验动物中心的主要组成部分之一。现有普通级豚鼠、兔生产车间1200平方米，普通级犬生产车间1000平方米，清洁级大鼠、小鼠生产车间1000平方米以及动物饲料加工车间300平方米。

实验动物所主要负责附属医院所需各种实验动物的生产、供应保障任务。实验动物所现有各种品种、品系动物16个，每年可生产供应实验动物10万余只，有力的保障了大学及两个医院的医疗、教学、科研、生产、检定用动物的需要。实验动物还远销包括香港在内的10多个省（区）军地医药科研单位，有力地支援了地方医药、科研单位的教学、科研、产品检定工作 。